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本文利用ＲＡＰＤ技术对我国２８个玉米骨干自交系进行了分析，从３００个引物中筛选出了４０个多态性好的引物，结果发现：仅使用ＯＰＩ１０一个引物矿增的ＤＮＡ指纹图谱就能区别开１５个自交系，增加引物ＯＰＢ７可以区分开２６个自交系，再增加ＯＰＣ１９、ＯＰＧ６、ＯＰＡ７、ＯＰＩ１１、ＯＰＧ１４中的任何一个引物就可以将２８个交系完全区分开。研究表明亲缘关系很近，利用同工酶方法无法区分的姊妹系材料如：４７８、４８