目的:通过连续性监测EV71病毒核酸,研究手足口病患儿感染EV71病毒后在粪便中的排毒时间、病毒载量及其相关因素。方法:观察45例EV71患儿12周,及非EV71组27例作为对照。每隔7 d收集粪便1次,采用real-time PCR Taq Man探针法定量检测病毒核酸。并用Kaplan-Meier生存分析法进行数据分析。结果:57例(79.2%)患儿为持续排毒(EV71 39例,非EV7118例),有15例(20.8%)为间歇排毒(EV71组6例,非EV71组9例)。在持续性排毒中,EV71组患儿在第1~7周病毒核酸阳性率均为100%,第8~12周分别为94.4%、91.2%、81.6%、81.6%、81.6%,非EV71组在第1~10周病毒核酸阳性率分别为100%、88.9%、83.3%、72.2%、55.5%、23.2%、38.9%、22.2%、14.8%、14.8%、14.8%。这2组粪便核酸阳性率分布有统计学差异(t=4.00,P=0.00)。EV71组与非EV71组患儿的病毒载量在第9周有统计学意义(Z=-2.17,P=0.03)。EV71与非EV71重症组、EV71与非EV71普通组及EV71普通组与重症组患儿的病毒载量在各随访时间内均无统计学意义(P>0.05)。EV71组患儿病毒载量在年龄和性别上均无统计学差异(χ~2=3.15,P=0.21;Z=-0.03,P=0.98)。结论:手足口病患儿多数为持续排毒,可持续12周以上,EV71组排毒时间长于非EV71组;但EV71组病毒载量低于非EV71组。EV71组病毒载量与年龄和性别无关。