【摘 要】
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目的 在生物信息学分析基础上初步探讨异位妊娠mircoRNA及LncRNA调控网络的初步构建,探讨microRNA及LncRNA在异位妊娠细胞中的分子调控机制.方法 通过miRwalk 2.0软件及HMDD
【机 构】
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通江县人民医院医院 妇产科 四川通江 636700
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目的 在生物信息学分析基础上初步探讨异位妊娠mircoRNA及LncRNA调控网络的初步构建,探讨microRNA及LncRNA在异位妊娠细胞中的分子调控机制.方法 通过miRwalk 2.0软件及HMDD v2.0精准查询功能明确异位妊娠的相关查询已证实与异位妊娠相关的microRNAs,根据miRwalk 2.0软件出现频次进行筛选,明确重要研究microRNA 5个,通过miRwalk 2.0明确其对应靶基因表达情况.在lncRNA疾病数据库查询与异位妊娠相关的lncRNAs(long noncoding RNAs),并运用starBase v2.0对所得到的microRNAs和lncRNAs进行综合分析,得到与上述microRNAs相互作用的且与异位妊娠相关的lncRNAs.通过Cytoscape软件绘制microRNA在异位妊娠中的分子调控网络.结果 hsa-mir-149、hsa-mir-223、hsa-mir-182、hsa-mir-424、hsa-mir-323a是介导异位妊娠调控的重要microRNA,成功获取了有关microRNA在异位妊娠中的分子调控网络;并初步明确了高频microRNA,lncRNA与microRNA匹配分析发现,lncRNA XIST(X inactive-specific transcript)作为核心调控因子与高频microRNA相互作用介导异位妊娠基因调控.结论 mircoRNA及LncRNA调控在异位妊娠调控的过程中具有重要的作用,miRwalk、HMDD、Starbase等数据库可以有效的用语microRNA与疾病关系研究.
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