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以热带玉米自交系B31-3与温带自交系黄早四杂交得到的F8代重组自交系群体为材料.筛选出153个多态性SSR标记,以此为基础构建遗传连锁图谱。对这些多态性标记进行偏分离分析,发现48个表现为偏分离(P〈0.05).这些偏分离标记中有30个标记位点偏向母本B31.3,占62.50%,18个标记位点偏向父本黄早四。占37.50%。这些偏分离标记在图谱上的分布有2种:成簇分布和孤立位点的偏分离。在10条不同染色体上共发现9个偏分离热点区域。这些偏分离热点区域的形成可能与配子体选择有关。