目的：研究对甲状腺功能亢进症患者采取不同疗程碘131治疗的临床效果。方法：将我院2012年2月~2013年3月90例甲亢患者以抽签法随机分为观察组与对照组，2组均采取常规剂量治疗，3个月为1疗程，观察组共2疗程，对照组3疗程，另选同期健康体检者20例，对比3组患者心功能及甲状腺功能变化情况。结果：观察组治疗总有效率为86.67%，与对照组88.89%，差异无统计学意义（P＞0.05），观察组甲状腺功能下降率为2.22%，显著低于对照组的13.33%，差异有统计学意义（P＜0.05），2组复发率分别为4.44%、6.67%，对比差异无统计学意义（P＞0.05）。经不同疗程治疗后2组左右心室功能差异无统计学意义（P＞0.05），稍高于正常组，但差异无统计学意义（P＞0.05）。结论：不同疗程碘131治疗甲状腺功能亢进症均可改善甲状腺功能与心功能，但比较而言2疗程的治疗方案兼顾了疗效与安全性，可避免甲状腺功能下降，因此临床治疗中可将2个疗程作为最佳治疗疗程。