【摘 要】
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分子标记缺乏是制约甘蔗分子标记技术发展的重要因素。本研究利用甘蔗AP85-441和R570基因组参考序列,使用MISA软件分别鉴定出512835和97839个微卫星位点,分别占割手密基因组(
【机 构】
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中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,中国热带农业科学院湛江实验站,广东省旱作节水农业工程技术研发中心,中国农业科学院农业基因组研究所
【基金项目】
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国家重点研发计划项目子课题(No.2018YFD1000503);中国热带农业科学院科技创新团队专项资金项目(No.17CXTD-07)
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分子标记缺乏是制约甘蔗分子标记技术发展的重要因素。本研究利用甘蔗AP85-441和R570基因组参考序列,使用MISA软件分别鉴定出512835和97839个微卫星位点,分别占割手密基因组(AP85-441)和甘蔗基因组(R570)高质量参考序列的0.32%和0.35%。在2个基因组序列中,优势重复单元均为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,各重复单元均以AT富集的基元为主。割手密和甘蔗基因组序列中分别有472117和89748个位点可以开发SSR标记。对割手密、甘蔗与高粱基因进行同源性分析,分别鉴定出1669
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