新疆主栽杏品种自交不亲和SFB基因的检测

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为系统鉴定新疆主栽杏品种自交不亲和SFB基因型,以新疆25个主栽杏品种为试材,利用蔷薇科保守序列设计引物对叶片基因组DNA进行SFB基因特异PCR扩增,筛选出有效的扩增引物;对成功扩增的杏品种的特异条带克隆测序,在GenBank上进行BLASTN比对,确定各品种的SFB基因型。结果显示:引物组合Ⅱ-1、Ⅳ-2,1-Ⅰ、1-Ⅱ对新疆杏品种的扩增效果最好,成功地在18个品种上扩增出了5种大小不同的条带,14种不同的基因型,其中两个基因(SFB-36,SFB-42)与GenBank上已经登录的SFB-13(the Accession No.EF062342)为同一基因,其余12个为新基因,暂命名为:SFB-30、SFB-31、SFB-32、SFB-33、SFB-34、SFB-35、SFB-37、SFB-38、SFB-39、SFB-40、SFB-41和SFB-43。对扩增出的SFB氨基酸序列进行比较,发现3个保守区和两个高变区;将试验所得基因与李属果树62个SFB基因构建系统进化树,显示李属果树SFB基因的种内相似性并不高于种间相似性。
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