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目的:采用RNA-seq技术检测脓毒症大鼠24h、48h脾组织mRNA的表达变化，从而分析脓毒症脾功能障碍可能的机制。方法:运用随机数字表法将30只清洁级健康雄性Wistar大鼠等分为对照组、脓毒症组。脓毒症组采用盲肠结扎穿孔术(CLP)来建模。对照组仅行开腹、关腹。2组术毕均肌肉注射平衡液5 mL/kg。术后24 h、48 h各组随机取5只大鼠取脾组织提取RNA后采用RNA-seq进行mRNA检测，应用生物信息学软件分析脓毒症大鼠脾组织mRNA随时间变化的表达差异及涉及的相关通路。结果:大鼠建模后24、48小时，相对于对照组，脓毒症大鼠脾脏组织mRNA表达上调数分别为1 030个，1 354个，下调数分别为935个，1 763个。其中，脓毒症大鼠脾组织随时间变化，细胞因子-细胞因子受体相互作用通路及凋亡相关通路相关mRNA表达差异明显。脓毒症大鼠脾组织细胞因子及其受体相互作用相关信号通路的mRNA表达情况为脓毒症24 h大鼠脾组织mRNA表达上调，而48 h转为下调的基因有2个，上调转为正常表达有22个，正常表达转为下调有30个，表达下调转为上调有1个，下调转为正常表达有2个，正常表达转为上调有10个。细胞凋亡相关通路中，脓毒症大鼠24 h脾组织mRNA表达上调，而48 h转为表达下调有1个，从表达上调到正常表达有5个，从正常表达到表达下调有9个，从正常表达到表达上调有10个，从表达下调到表达上调有1个，从表达下调转为正常表达有1个。结论:早期过度炎症反应，晚期免疫抑制是脓毒症重要机制之一。其机制可能跟细胞-细胞因子受体、凋亡通路相关基因表达有关。