前列腺癌差异表达基因的分析及其miRNA和lncRNA的预测

来源 :贵州医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woailzm002
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目的:筛选前列腺癌的差异表达基因及其上下游的调控分子。方法:通过TCGA数据库和GEO数据库,经RSudio软件分析得到差异基因(DEGenes);采用STRING工具构建差异基因的相互作用网络、CYTOSCAPE软件筛选核心模块,并对差异基因进行GO和KEGG分析,运用mirDIP数据库预测核心基因的miRNA,登录STARBASE对miRNA进行生存分析并预测其lncRNA。结果:筛选出前列腺癌的差异表达基因共137个,GO分析结果显示有23个富集结果,KEGG分析有20个通路被富集;对7个核心差异基
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