香蕉枯萎病菌热带4号小种基因组规模分泌蛋白的预测与分析

来源 :江苏农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:vialli_7
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为了明确香蕉枯萎病菌热带4号小种(Fusarium oxysporum f.sp.cubense tropical race 4,Foc TR4)与香蕉互作的分子机理,本研究利用SignalP、WoLF PSORT、TargetP、TMHMM和big-PI Predictor等软件,对Foc TR4全基因组22 487条蛋白质氨基酸序列进行了经典分泌蛋白的预测分析。结果表明,Foc TR4全基因组编码蛋白质中有1 054个经典分泌蛋白,占编码蛋白质总数的4.7%。蛋白质特征分析结果表明,其氨基酸序列长度集中在100~500个氨基酸,信号肽长度集中在17~22个氨基酸,信号肽切割位点以SPaseⅠ型为主。功能预测分析结果表明,有463个经典分泌蛋白获得了注释,主要涉及糖代谢、水解酶活性等。碳水化合物酶类(CAZymes)的分析结果表明,有281个分泌蛋白为CAZymes,其中以GH家族最多。此外,利用Secretome P软件对Foc TR4非经典分泌蛋白进行了分析,发现有9 216个蛋白质氨基酸序列,占编码蛋白质总数的41.0%。
其他文献
从分析道路纵断面特性与土石方关系入手,提出了一种用道路纵断面和地面自然特性推求土石方工程量的新公式。实际工程验证表明:该方法比原计算方法节省外业工作量、计算方便,
从富氧膜的物化形态与分离机制方面论述了富气膜的选择和制备原理及膜材料研究的进展,综述了膜组件的形式、设备、工业应用和经济效益,并指出了我国富氧膜的研究现状和今后的
在经济发展下,建筑行业空前壮大,同时又推动了经济发展.在建筑中,成本管控是一项紧要工作,管控好成本,才能在安全施工、质量保证的同时,获得最大效益,推动建筑单位长远发展.
针对东部草原煤矿区土壤贫瘠、生物种群单一以及植物抗逆性差等问题,采用盆栽方法研究了施氮(0mg/kg、100 mg/kg)与接种丛枝菌根(AM)真菌(0 g/kg、50 g/kg)协同对玉米生长状
目的:探讨CT对胆囊癌肝侵犯的诊断价值。方法:回顾性分析25例经CT检查,并经临床证实为胆囊癌肝侵犯的CT表现。结果:25例胆囊癌肝侵犯的病例中有21例CT作出了正确的的诊断,CT
随着经济的不断发展,市场化经济的不断推进,企业之间的竞争日益激烈。各企业之间除了运用新技术提升自身的经济实力以外,还更加注重成本管理,尤其是在建筑工程项目管理中。做
为明确不同甘薯品种与病菌互作中抗氧化酶活性变化与甘薯抗性的关系,选用抗病甘薯品种郑红22、胜利百号和感病品种烟薯25、龙薯9号、徐薯33,利用愈创木酚方法,研究了甘薯与镰
为了探讨利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)体系在小麦穗部进行基因沉默的可行性,用大麦条纹花叶病毒诱导苏麦3号小麦穗部PDS基因的转录后沉默,再接种禾谷镰刀菌进行抗性鉴定。结
以Φ 76 mm少机架三辊连轧管机组的实践应用为背景,从生产成本、成材率、投资与运营维护、自动化水平、节能环保等多方面,对该机组与穿孔+冷轧(拔)机组进行了对比.认为在生产小
<正>B族维生素是人体必需的营养元素,常见的有维生素B1、维生素B2、维生素B3、维生素B6等。但大家都了解它们的功效吗?1.维生素B1可治疗脚气病患"脚气病"的人经常出现脚趾湿
期刊