【摘 要】
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对海量数据的处理,最有效的方法是并行计算.因此,对DNA序列比对进行并行化,以及对BLAST算法进行并行化改进,以提高对大数据量处理的能力.尽管在CLUSTER上的计算效率较超级计
【机 构】
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武汉理工大学理学院,华中科技大学计算机科学学院,武汉理工大学理学院
【出 处】
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武汉理工大学学报：交通科学与工程版
论文部分内容阅读
对海量数据的处理,最有效的方法是并行计算.因此,对DNA序列比对进行并行化,以及对BLAST算法进行并行化改进,以提高对大数据量处理的能力.尽管在CLUSTER上的计算效率较超级计算机上的效率低,但CLUSTER较超级计算机费用低,有较大的适用性.而高性能计算机是处理海量数据的强有力的工具,生命科学中计算问题必须进行超级计算已是不争的事实,现代生命科学对超级计算已显示出强烈依赖和迫切需求.文中对BLAST算法进行改进,提出一种局部并行化的DNA序列比对算法,为了检验算法的科学性和适用性,将此算法与超级计算
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