为了加快籽用南瓜的品种改良和选育进程,为籽用南瓜育种提供更多优良亲本选择,基于形态学标记对38份籽用南瓜种质进行遗传多样性分析,得出籽用南瓜材料50个植物学性状间的相关性及供试材料间的亲缘关系。结果表明,38份籽用南瓜种质植物学性状的变异系数范围为8.52%～86.29%,遗传多样性丰富;利用DPS 11.5软件对供试籽用南瓜材料的植物学性状数据进行R型聚类分析,在欧氏距离为8.66时,可将50个形态学性状分为三大类;进行系统聚类分析得出,在欧氏距离为10.38时,可将38份籽用南瓜材料分成四大类,可完全将38份材料区分开来;主成分分析结果得出,38份籽用南瓜种质资源可分成五大类,与形态学系统聚类所得结果基本一致。综合所有遗传参数得出,瓜形指数、瓜面蜡粉、老瓜瓜面斑纹、瓜瘤多少、老瓜皮色5个性状是籽用南瓜遗传多样性的代表性状;种子千粒重、老瓜肉厚和老瓜内腔纵径可作为评价籽用南瓜品种的综合性指标。