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以十和田/昆明小白谷225个F14家系为作图群体,在云南省弥勒县(正常生长环境)、嵩明县(自然低温胁迫环境)、丽江市(自然低温胁迫环境)等3个试点不同年份共5种不同生长环境下进行了水稻主穗和分蘖穗穗伸出度的异地鉴定,并利用SSR标记对水稻穗伸出度进行了QTL分析.检测结果表明,在5种不同的生长环境下共检测到12个与水稻穗伸出度相关的QTL,分别分布于第1(2个QTLs)、2、4、6(3个QTLs)、7(3个QTLs)、9(2个QTLs)号染色体,对表型的贡献率为3.72％～22.17％.其中与主穗穗伸出度相关的QTL共11个,与分蘖穗穗伸出度相关的QTL共7个,其中6个在主穗和分蘖穗上均检测到.在与主穗穗伸出度相关的11个QTL中,qPE-7-1在4种环境下均被检测到,解释的表型变异为9.49％～ 22.17％;qPE-1-1、qPE-1-2、qPE-6-1和qPE-9-2 4个QTL在2种环境下均被检测到.在与分蘖穗穗伸出度相关的7个QTL中,qPE-1-2、qPE-7-1和qPE-6-1 3个QTL在2种环境中均被检测到,解释的表型变异率分别为4.35％ ～ 12.64％、13.22％ ～ 20.89％和11.49％～15.73％.