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杂交制种问题一直是制约新疆杂交棉推广的主要瓶颈。本文介绍了几种新疆常用的杂交棉制种方法，并比较新疆与内地在杂交棉制种方法上的异同：不同的制种方法在两地的制种效率明显不同。内地采用人工去雄授粉法制种效果最佳，其次是免去雄套管隔离制种法，不育系人工制种法产量较低；而新疆正好相反。建议新疆采用免去雄套管隔离制种法进行常规杂交棉制种，不育系人工制种法将成为生产杂交种子的主要方式。