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野生大豆主的原生木质部为四原型,侧根多为三原型;次生木质部导管的口径侧根比主根大;气孔器属平列型;花药4室;成熟花粉粒为2细胞型,具3萌发孔;柱头和花柱的交界处有2轮指状细胞;胚珠弯生,珠被2层,具厚珠心;胚囊蓼型。野生大豆根的次生木质部导管的口径比栽培大豆大,有些叶中的平脉叶肉细胞为1-3层,植株上有腺毛,种皮表面有较厚的蜡质附属物,说明野生大豆比栽培大豆更能适应环境的特性。