【摘 要】
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应用454测序技术对红花(Carthamus tinctorius L.)初花期和盛花期两个样本进行转录组测序,分别获得了577 664和562 930条Clean reads片段,其平均长度分别为427 bp和436 bp。
【机 构】
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吉林农业大学生物反应器与药物开发教育部工程研究中心,吉林农业大学生命科学学院,
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应用454测序技术对红花(Carthamus tinctorius L.)初花期和盛花期两个样本进行转录组测序,分别获得了577 664和562 930条Clean reads片段,其平均长度分别为427 bp和436 bp。差异表达分析结果发现,在初花期获得40 139个基因,盛花期获得39 768个基因,在两个时期同时表达的基因有28 316个。COG/KOG分析中,获得了大量与代谢相关的功能注释信息,注释到比例最高的为功能预测,占24.681%。KEGG Pathway富集分析中,找到红花黄酮化合物合成途径中的关键酶基因,利用Real-time PCR方法验证了三个基因的正确性。表达量分析表明,查尔酮合酶在两个红花品种中各个开花时期的相对表达量最高。
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