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目的 研究2006年深圳市急性肠胃炎发病的主要病因.方法 收集深圳急性肠胃炎粪便样本200份(包含122份散发样本和78份暴发样本),采用RT-PCR的方法进行急性肠胃炎相关病毒检测.结果 44％ (88/200)的样本为诺如病毒阳性,9％(18/200)为轮状病毒A阳性,2％(4/200)为星状病毒阳性,2％ (4/200)为肠道腺病毒阳性,还有8％ (16/200)的样本为混合感染.其中散发样本中检出腺病毒、轮状病毒、星状病毒和诺如病毒GⅠ、诺如病毒GⅡ 5种病毒,而诺如病毒GⅡ是3次暴发样本中的唯一病原.对22例NoⅤ GⅡ阳性样本测序后的系统发育分析表明NoⅤ GⅡ.4 variants 2006b cluster是造成2006年深圳市肠胃炎暴发的主要诱因,其次为NoⅤ GⅡ.12和GⅡ.4 Hunter簇.结论 NoⅤ GⅡ.4是2006年流行于深圳的主要病毒株.