利用生物信息学发现长链非编码RNA DSCAM-AS1为肺腺癌潜在治疗靶点

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目的筛选肺腺癌的潜在靶点,运用生物信息学探索肺腺癌发病机制。方法癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)收集并整理有关肺腺癌长链非编码RNA(lncRNA)的数据,利用R语言筛选癌和癌旁表达差异的lncRNA,并预测它们的靶基因,用Cytoscape软件进行基因本体(GO)分析和蛋白相互作用网络(PPI)构建。结果1476个lncRNA在肺腺癌中差异表达,其中1230个上调,246个下调;其中表达差异最显著的是DSCAM-AS1。通过共表达网络积分分析识别出DSCAM-AS1对应的41个可能的靶基因。基因本体论富集
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