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分析系统发育基因组工作流程并行处理性能，提出了一种适用于云计算平台中SciPhylomics执行的性能评估工作流程。首先，介绍了映射化简模型的应用实现Hadoop；然后，呈现了SciCumulus云工作流程引擎；最后，在亚马逊EC2云上使用两种并行执行方法（SciCumulus和Hadoop）实施工作流程。实验结果表明，尽管系统发育基因组学实验对计算环境要求严格，但实验仍然适合在云中执行。此外，所评估的工作流程呈现出几组数据密集型工作流程的许多特征，本方法可以扩展到其他实验类型。