基于草莓基因组序列高通量开发月季SSR标记

来源 :西南农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hzduoying001

【摘要】

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研究根据草莓基因组和月季基因组的同线性关系,高通量开发月季SSR共显性标记。利用MISA软件对总长206.8Mb的草莓基因组序列进行扫描,共识别49 029个SSR位点,平均每4.2 kb包含

【作者】

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李淑斌周宁宁王其刚陈敏周青蹇洪英晏慧君邱显钦

【机构】

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云南省农业科学院花卉研究所,国家观赏园艺工程技术研究中心,云南省花卉育种重点实验室

【出处】

：

西南农业学报

【发表日期】

：

2015年6期

【关键词】

：

草莓属月季基因组同线性 SSR开发 Fragaria vesca Roses Genome synteny SSR development

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目（31160402）, 云南省科技计划项目（2013FZ148）

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研究根据草莓基因组和月季基因组的同线性关系,高通量开发月季SSR共显性标记。利用MISA软件对总长206.8Mb的草莓基因组序列进行扫描,共识别49 029个SSR位点,平均每4.2 kb包含1个SSR位点。利用primer3软件成功对21 288个SSR位点设计引物。利用中国古老月季品种‘月月粉’（Rosa chinensis‘Old blush’）和园艺品种‘无刺光叶蔷薇’（Rosa wichuriana‘Basye’s thornless’）,随机选取300对SSR引物进行PCR扩增,40对引物获得

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