论文部分内容阅读
目的
研究食管鳞状细胞癌(ESCC)的肿瘤内异质性。
方法采用全基因组外显子测序和微阵列比较基因组拷贝数杂交的分析方法，对2例ESCC患者肿瘤内11个区域的全基因组基因突变及拷贝数变化进行检测，同时检测包括转移淋巴结基因组突变及拷贝数的变化。
结果例1和例2患者4个肿瘤区域的单核苷酸多态性(SNPs)数目分别为(93±17)个和(124±28)个。这些SNPs主要为非同义突变、同义突变、无义突变、剪接位点突变。例1和例2患者的4个肿瘤区域缺失数分别为(40±6)个和(51±3)个。这些缺失主要发生于基因外显子(移码突变或非移码突变)、非翻译区及基因拼接区。所有肿瘤内各个区域均表现出明显的异质性，同一肿瘤不同区域基因突变谱仅有的相似性<25%。肿瘤多个区域出现基因拷贝数增加或丢失，同一肿瘤不同区域基因拷贝数相似性<20%。肿瘤进化分析表明，多个肿瘤细胞克隆共存于ESCC原发灶，转移性亚克隆可能来自于原发灶的肿瘤细胞克隆。ESCC单区域取样不能反映肿瘤基因突变的全貌。
结论ESCC多区域的全基因组外显子测序研究可以为ESCC的肿瘤内异质性提供有力的证据。