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细胞归入哪一类具体谱系？由不同基因的沉默所控制。后者又取决于像DNA甲基化和组蛋白改变等表观过程。胚胎形成的早期，哺乳动物基因组擦抹干净（wiped clean）使大多数表观修改。它们在胚胎形成过程中又重新建立起来。这样，每一成熟细胞谱系的表观组都带着它的发育史。以后的发育的轨道和类型亦回应于环境的影响。