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经野外调查和资料分析整理，确定南京城市森林共有野生蕨类植物25科36属63种（含变种），主要科为鳞毛蕨科、金星蕨科、蹄盖蕨科、铁角蕨科，主要属为铁角蕨属、鳞毛蕨属、复叶耳蕨属、贯众属。分布区类型在科的等级上，以热带成分占一定主导地位，在属的等级上，热带成分较温带成分占优势，表明南京城市森林的蕨类植物具有较强的从热带向亚热带、温带过渡的特性。在种的水平上，有超过一半的物种是东亚分布成分，表明该区蕨类植物区系地理成分属于东亚植物区系。特有成分相对匮乏，有一定的原始性。