【摘 要】
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目的 明确免疫相关基因的表达与早期肾透明细胞癌预后之间的关系,建立早期肾透明细胞癌免疫相关基因的预后模型,并评估该模型与肿瘤浸润免疫细胞之间的关系.方法 下载TCGA公
【机 构】
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中国医学科学院,北京协和医学院,北京协和医院 泌尿外科,北京 100730;青岛大学附属医院 泌尿外科,山东 青岛 266003
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目的 明确免疫相关基因的表达与早期肾透明细胞癌预后之间的关系,建立早期肾透明细胞癌免疫相关基因的预后模型,并评估该模型与肿瘤浸润免疫细胞之间的关系.方法 下载TCGA公共数据中早期肾透明细胞癌的RNAseq数据及相应的临床信息,收集2018年1月至3月于北京协和医院泌尿外科经病理确诊为早期肾透明细胞癌的肿瘤组织及癌旁正常组织27对,采用液相色谱-质谱定量检测组织中的免疫相关蛋白的表达水平.根据相应的阈值,同时存在RNA和蛋白水平差异性表达的基因视为差异分子,构建基于差异免疫分子的预后模型,并计算每个样本的风险得分,使用TIMER在线网站计算肿瘤浸润免疫细胞的分布,利用Spearman相关性分析,评估肿瘤免疫基因的风险得分与肿瘤浸润免疫细胞之间的关系.结果 本研究共筛选出261例TCGA早期肾透明细胞癌患者的RNAseq数据及相应的临床预后信息,同时收集了27对组织样本.通过差异性分析,最终确定了ARG2、HRG等15个差异性表达分子.COX线性回归模型建立了由FCGR3A、ZAP70、C3、VAV1、ANGPTL4所构成的预后模型,且高风险组的预后显著差于低风险组,差异有统计学意义(P=0.0024).多因素分析提示,由该模型所确定的风险分层是患者的独立预后因素(HR=1.7,P=0.021).相关性分析提示,肿瘤的风险得分与树突状肿瘤浸润免疫细胞具有相关性,差异有统计学意义(P<0.01).结论 由5个免疫基因所构成的早期肾透明细胞癌预后模型可以准确地预测患者的预后,且与肿瘤微环境中的树突状细胞具有相关性.
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