10株新城疫病毒广西分离株HN蛋白基因的克隆与序列分析

来源 :中国畜牧兽医学会禽病学分会第12次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huang267321
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根据基因库(Gene Bank)的新城疫病毒(NDV)的HN基因序列设计了2对特异性引物,应用RT-PCR技术对广西在2000-2003年暴发新城疫的鸡群中分离的10株NDV毒株的HN基因进行了扩增,扩增产物克隆并测序,拼接出10个NDV广西分离株的HN基因的全序列.10个NDV广西分离株的HN基因核苷酸序列全长均为1713bp,编码571个氨基酸,序列中有13个半胱氨酸残基,其中GX8/03有6个糖基化位点,而GX2/00、GX6/02、GX7/02和GX5/00有5个糖基化位点,GX1/00、GX3/00、GX4/00和GX9/03有4个糖基化位点.除GX5/00和GX10/03分离株外,其它8个NDV分离株在HN基因抗原位点I发生变异,即347位由谷氨酸(Glu)变异为甘氨酸(Gly),GX8/03分离株在HN基因在抗原位点Ⅱ的495位由赖氨酸(Lys)替代谷氨酸(Glu).与11株已发表的NDV HN基因序列相比较,其核苷酸同源性在79.6﹪-99.6﹪,推导的氨基酸同源性在87.3﹪-99.1﹪之间.
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