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科技创新是武陵山试验区建设发挥后发优势的必经路径。恩施州科技创新虽有所发展，但还是相对落后。其原因主要是科技意识、经济水平、科技人才不足等。建议从强化科技创新意识、创新科技投入方式、建立企业技术创新长效机制、加强科技创新服务体系等四方面构建恩施州科技创新战略，并提出以科技创新带动特色农产品资源开发、创新人才建设和充分发挥科技部门服务职能等方面是实现科技创新战略的关键路径。