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现代刑事诉讼结构的理论基础是西方自由主义。西方自由主义决定了现代刑事诉讼结构中逐步实现了追诉权与裁判权的严格分离，被追诉者的基本权利得到立法确认并最终由中立的裁判者予以落实。在现代刑事程序中，被追诉者成为诉讼主体，他的诉讼利益获得承认，以往的国家利益出现分化，构成了以被追诉者诉讼利益为核心的分层结构。被追诉者的诉讼利益始终要高于追诉方代表的国家或社会利益、裁判方代表的公正利益，形成了现代刑事诉讼的利益结构。不同的诉讼利益由不同的主体来维护，各方主体以权利制约权力、权力约束权力的方式参与到刑事诉讼的主要过程