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目的探讨运用测序技术鉴定临床感染标本中病原菌的应用价值。方法运用聚合酶链反应（PCR）扩增及454焦磷酸测序技术，对标本中病原菌16S—rDNAV3区进行多样性分析；并与细菌培养结果相比较。结果测序能检测出临床不宜培养的菌属，如支原体属、嗜血杆菌属、莫拉菌属等；9种菌属为2种方法共同检测所得，7种菌属的P值均〈0．05。结论2种方法的检测敏感性差异有统计学意义；与细菌培养相结合是临床实践中的一种新的偿试。