【摘 要】
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换锦花是我国重要的观赏和药用花卉,其植株富含多种生物碱成分,具有良好的经济价值和社会价值。但是换锦花同许多药用植物一样,缺乏基因信息,这限制了其基因功能的挖掘和研究
【基金项目】
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上海市农委攻关项目沪农科攻字(2016)第5-3号石蒜生物碱含量分析与高效繁育关键技术研究;上海市农委攻关项目沪农科攻字(2014)第1-2号新优球根花卉盆栽资源收集和种质创新;上海市农委应用基础项目沪农科攻字(2016)第6-1-6号石蒜种球生长发育与休眠生理研究;上海市花卉产业技术体系建设和上海市农委产业体系建设专项沪农科产字(2017)第8号共同资助
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换锦花是我国重要的观赏和药用花卉,其植株富含多种生物碱成分,具有良好的经济价值和社会价值。但是换锦花同许多药用植物一样,缺乏基因信息,这限制了其基因功能的挖掘和研究。本研究以盛叶期换锦花的鳞茎和叶片混合样品为材料,利用Illumina Next SeqTM500测序平台对其进行转录组测序,共获得42 509 194条干净数据(clean reads),总碱基数为6 242 970 322 bp。Clean reads经de novo组装后获得86 243条unigenes。进一步利用五大公共数据库进行同源比对,共注释到42 818个Unigenes。对Unigenes进行GO和KEGG功能分类,分别获得67个功能群和263个Pathway,发现了部分生物碱合成途径的候选基因,并查找到11 626个SSR位点。本研究为换锦花生物碱合成分子机理的研究和遗传多样性分析奠定基础。
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