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来自波罗的海北部的缺氧性深海水流的流入有规律地影响着芬兰湾。这些密集的水流大范围推进，导致受影响区域内海底生物的减少。这样的事件在几十年或几百年内有规律地重复发生。群岛海区域却受到很好的保护，因为缺氧的深海水流不会进入这样的浅水区。群岛海区域的海底生物的状况本来应该好一些，但是在许多区域情况并非如此。在那些海底不会受到风暴和洋流袭击的区域，永久性的缺氧可能持续几十年。这样的区域在芬兰湾的群岛海区域西部被发现。对表面岩心的研究表明许多这样的盆地的缺氧状况已经持续了差不多40年。对更深一些的岩心的研究表明，至