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鉴于肿瘤基础研究与临床研究长期脱节所致基础研究成果难以及时有效地转化为临床应用,近年以肿瘤转化医学理念为纽带的、加强并加快临床问题与基础成果双向转化的新思路逐渐成为业界共识.随着现代分子生物学和细胞生物学技术的迅猛发展,高通量深度测序、表观遗传学及微环境调节已在探索肿瘤标志物、阐析肿瘤发生发展机制中显示出强大的生命力.笔者拟简介及展望以临床问题或临床样本检测为出发点的深度测序、表观遗传学及微环境在当前肿瘤研究中的作用及应用。