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卡氏肺囊虫是引起免疫抑制患者卡氏肺囊虫肺炎的重要条件致病菌。以PCR为基础的基因诊断方法显示了广阔的应用前景。已用于Pc-PCR的支基因有核5SrDNA,18SrDNA,ITS,mtLSUrDNS,TS和DHFR等,其方法各具特色。就其敏感性和特异性而言,Pc-ITS-PCR法和Pc-mt LSUrDNA-PCR法较其他的PCR法优越,值得推荐。