目的 分析区县级结核病防治机构(简称“结防机构”)运送痰标本到地市开展基因芯片耐药检测的成本,为完善耐多药结核病患者发现策略提供数据基础.方法 选取中国不同地区3个具有代表性的项目点,包括江苏连云港,河南开封和重庆永川,收集2011年1月至2012年2月期间数据,采用简单法,根据运送次数、单次运输成本及运输标本数计算单位患者标本运输成本;采用简单法和时间-观察法对3个项目地区基因芯片检测成本进行分析.结果 自2011年1月至2012年2月,连云港、开封和永川三地单位患者运输成本分别为72.47元、84.67元和117.00元,其中运输成本与单次运输患者例数相关,其中单次运输患者例数较少的永川(1.71例/次,552/323)单位患者运输成本最高,而单次运输患者较多的连云港(2.76例/次,712/258)单位患者运输成本最低.此外,完成基因芯片检测的单位成本为141.56元,其中扩增占全过程总成本的69.0％(97.63元);其次为杂交,占总成本的11.9％(16.79元).在各试验过程中均以试剂、耗材及管理成本所占比例较高,分别占总成本的60.2％(85.26元)、17.5％(24.78元)和12.7％(18.00元).考虑到标本运输和基因芯片检测,完成1例患者检测的总成本约为230.84元,运输频次从每2周4次减少至每2周1次时,标本运输成本占总成本由33.5％降低为11.2％.结论 本研究表明,影响县级机构运送痰标本开展耐药结核病快速检测成本的主要因素包括单次标本运输例数和基因芯片价格.综合考虑运输成本和检测效果,运输频次为2周1次为宜.此外,标本转运开展结核病快速检测模式更适合于人口稠密的中东部地区.