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神农架长坊二级电站库区内有国家Ⅱ级保护陆生野生脊椎动物14种，中国特有鱼类4种，湖北省重点保护鱼类1种，无国家重点保护野生植物。在阐述神农架长坊二级电站工程影响区域生态环境基本特征的基础上，分析了区域生物多样性状况和电站建设运行后对生态环境的影响程度。结果表明，长坊二级水库电站建设所产生的负面影响很小，采取一定治理措施后可减免，能够达到环境可以接受的程度。