胃肠道、中枢神经系统和皮肤反应是喹诺酮类药物治疗中最常见的不良反应。某些新的喹诺酮类药物不良反应的剂量反应关系似乎存在。喹诺酮类药物神经毒性的发病机理尚不清楚。在相当多的患者中 ,曲伐沙星有中度中枢神经系统反应 ,年轻女性对此尤为敏感 ,治疗或进餐时服药不良反应减轻。司帕沙星和格帕沙星的心脏毒性的可能性高于其它喹诺酮类药物 ,治疗中除了轻度的 QT间期延长之外 ,没有明确的与药物相关的严重反应 ,但用于有 QT间期延长的患者中是有风险的。 8-位有卤原子的喹诺酮类药物光毒性显示最大的可能性 ,氟诺沙星、司帕沙星、克林沙星和洛美沙星属此类 ,其它新喹诺酮类药物的可能性相当低 ,但所有喹诺酮类药物治疗中应防止暴露于紫外光下。喹诺酮类药物的软骨毒性在幼体动物中作用于关节软骨和 /或骺增长板 ,其发病机理可由药物 -镁螯合特性解释 ,此类药物在儿科的使用应严格选择。喹诺酮类药物对连接组织结构的毒性作用是肌腱病症 ,在药物治疗迟达几个月后可发生肌腱炎和肌腱破裂。喹诺酮类药物有良好的耐受性 ,当用其作为细菌感染治疗的药物时 ,应考虑其特殊的药物毒性