【摘 要】
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采用RAD-seq(Restriction-site associated DNA sequencing)对印尼虎鱼(Datnioides pulcher)进行简化基因组测序,获得13308 806个高质量干净读长(HQ clean reads),利用SSR搜
【机 构】
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中国水产科学研究院珠江水产研究所,上海海洋大学水产与生命学院
【基金项目】
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中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2016GH07,2018GH19);中国-东盟海上合作基金(CAMC-2018F);国家水产种质资源共享平台(2019DKA30470)
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采用RAD-seq(Restriction-site associated DNA sequencing)对印尼虎鱼(Datnioides pulcher)进行简化基因组测序,获得13308 806个高质量干净读长(HQ clean reads),利用SSR搜索软件在所得序列中共检测到26359个SSR位点,由496种重复基序组成,主要分布在三、四、五碱基重复类型中,单碱基重复序列中最多的类型为A/T,二碱基重复序列中以AC/GT和AG/GT重复单元为主,三碱基重复序列中以AGG/CCT、AGC/CTG、
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