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鹿亚科共有4个属,各属间和属内特别是鹿属内的系统进化关系存在疑义.根据Cyt b基因序列分析,探讨了鹿亚科及中国鹿属、马鹿亚种的进化关系.结果分析表明:现行分类系统中,斑鹿属可能并非单系发生,暗示应将豚鹿并入鹿属;麋鹿属与鹿属有较近的进化关系,也应并入鹿属;(黄占)鹿属的进化地位有待进一步研究;归并后的鹿属为单系发生.中国马鹿各亚种在系统发生上是一单系群,其中马鹿天山亚种和阿尔泰亚种聚为最原始的一支.