江西部分地区猪粪便戊型肝炎病毒核酸检测及序列分析

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采集江西省A猪场2-3月龄猪粪便40份,B猪场2-3月龄猪粪便40份,利用反转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)RNA,结果表明,A猪场7份样品为阳性,阳性率17.5%。B猪场10份样品为阳性,阳性率25.0%。总阳性率21.3%。对4份PCR扩增阳性产物进行纯化并测序,利用生物学软件进行序列分析和进化树绘制,4个分离株ORF2 348 bp同源性为92.1%-97.5%,为同一基因型,与HEV1、HEV2、HEV3同源性分别为70.7%-
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