目的了解甘肃省儿童食源性疾病病例中主要食源性致病微生物感染分布情况,为制定有效防控措施和临床诊疗提供科学依据。方法收集2013—2015年来自甘肃省监测哨点医院的6 320例儿童病例数据,采集3 968份生物样品,分析其主要致病微生物检出情况。结果不同年龄段主要致病微生物检出率不同,6~14岁年龄组非伤寒沙门菌(3.54%)和志贺菌(2.25%)检出率最高(χ~2=11.76,P=0.01),1~2岁幼儿组致泻大肠埃希菌(3.23%,χ~2=21.72,P=0.01)检出率最高。诺如病毒在儿童各年龄段检出率均较高,年龄组间差异无统计学意义。儿童腹泻病例中非伤寒沙门菌和致泻大肠埃希菌每月检出率不同,非伤寒沙门菌检出率最高为3月(3.23%,χ~2=21.65,P=0.03),致泻大肠埃希氏菌检出率最高为8月(4.81%,χ~2=52.49,P=0.01)。儿童食源性疾病病例可疑暴露食品以乳与乳制品为主,水果类食品同样值得关注。结论儿童食源性疾病病例中不同年龄段主要致病微生物检出率不同,致病微生物检出高峰期不同。可疑暴露食品以乳与乳制品为主,水果类食品的暴露值得关注。