SARS冠状病毒主要蛋白酶构象运动性分析

来源 :北京大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：zengyuzhuo

【摘要】

：

SARS冠状病毒3CL蛋白酶的单体结构由3个结构域构成，其中第1、2个结构域紧密堆积成糜胰蛋白酶折叠类型，第3个结构域由5个α螺旋构成，较为独立。有实验证明3CL蛋白酶的α螺旋结构

【作者】

：

陈浩马文喆来鲁华

【机构】

：

北京大学化学与分子工程学院

【出处】

：

北京大学学报(医学版)

【发表日期】

：

2003年B05期

【关键词】

：

SARS 冠状病毒蛋白酶构象运动性分子动力学模拟 SARScoronavirus 3CLproteinase Proteinconformationalfl

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SARS冠状病毒3CL蛋白酶的单体结构由3个结构域构成，其中第1、2个结构域紧密堆积成糜胰蛋白酶折叠类型，第3个结构域由5个α螺旋构成，较为独立。有实验证明3CL蛋白酶的α螺旋结构域的缺失会影响酶的催化活性。另外3CL蛋白酶还有可能具有RNA结合功能。因此研究α螺旋结构域的作用有助于认识SARS冠状病毒3CL蛋白酶的生物功能。我们对于SARS冠状病毒3CL蛋白酶的单体分子进行了分子动力学模拟，采取全原子模型，加入溶剂水分子，进行了3次1ns的模拟。同时我们还利用弹性网络模型对于SARS冠状病毒3CL蛋白酶

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