基于高通量测序分析紫贻贝冻藏过程中菌群组成变化

来源 :食品与机械 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yangpingliu

【摘要】

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以蒸汽开壳后获得的新鲜紫贻贝肉(FS)、-18℃冻藏1周紫贻贝肉(FS-1)、冻藏3周紫贻贝肉(FS-3)和冻藏9周紫贻贝肉(FS-9)为研究对象,采用DNA抽提试剂盒提取贝肉表面微生物基因进

【作者】

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蒋慧丽水珊珊吴琼静陈晓楠张宾苏来金

【机构】

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浙江海洋大学食品与药学学院,温州市农业科学研究院温州市特色食品资源工程技术研究中心

【出处】

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食品与机械

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

高通量测序技术紫贻贝冻藏优势菌群多样性 high throughput sequencing mytilus edulis frozen dominan

【基金项目】

：

国家自然科学基金项目(编号:31871871),浙江省自然科学基金项目(编号:LY18C200008),温州市重大科技创新攻关项目(编号:N20180011,ZS2019001)

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以蒸汽开壳后获得的新鲜紫贻贝肉(FS)、-18℃冻藏1周紫贻贝肉(FS-1)、冻藏3周紫贻贝肉(FS-3)和冻藏9周紫贻贝肉(FS-9)为研究对象,采用DNA抽提试剂盒提取贝肉表面微生物基因进行高通量测序分析。各样本的有效序列区间为31 896~42 812条、操作分类单元(Operational taxonomic units,OTU)范围为289~681,其中OTU最少的是冻藏9周样品,最多的是新鲜紫贻贝肉。分析多样性指数可知,菌群丰富度最低的是冻藏3周紫贻贝肉。在属水平上,各样本优势菌群中均包含弧菌

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