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基于生物信息学分析筛选人类胃癌预后生物标志物

来源 :福建师范大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wangyizhinihao

【摘 要】

：

为筛选胃癌临床诊断和预后的新型生物标志物,利用GEO2R工具分析胃癌基因芯片数据集GSE79973,筛选差异表达基因;采用FunRich、STRING和Cytoscape对差异表达基因进行GO、KEGG分

【作 者】

：

李琳君 陈毅斌 林陈胜 

【机 构】

：

福建师范大学生命科学学院

【出 处】

：

福建师范大学学报:自然科学版

【发表日期】

：

2020年6期

【关键词】

：

胃癌 生物标志物 生物信息学 COL5A1 COL8A1 COL4A1 gastric carcinomabiomarkerbioinformaticsCOL5 

【基金项目】

：

福建省自然科学基金资助项目(2019J01281)

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为筛选胃癌临床诊断和预后的新型生物标志物,利用GEO2R工具分析胃癌基因芯片数据集GSE79973,筛选差异表达基因;采用FunRich、STRING和Cytoscape对差异表达基因进行GO、KEGG分析和蛋白互作网络构建;通过GEPIA比较候选基因在胃癌和正常组织中的表达水平;应用Kaplan-Meier Plotter和cBioPortal分析候选基因与临床胃癌的相关性及预后情况.通过数据分析,发现COL5A1、COL8A1和COL4A1的高表达对人类胃癌患者总生存期的危害最大,且在胃癌患者中这3个

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