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在动物体内环境中通常有微生物或微生物层,在正常情况下即动物处于健康状态时,并未表现异常或致病现象,称这层微生物为正常菌群或固有菌群和原籍菌群。动物的胃肠道栖息着大约30属500多种细菌,主要由厌氧菌、兼性厌氧菌和需氧菌组成,其中专性厌氧菌占99%以上,而仅类杆菌及双歧杆菌就占细菌总数90%以上。这些菌群是动物机体内环境中不可缺少的组成部分,在正常情况对动物宿主是有益无害的。肠道固有菌群对动物免疫力有如下几方面的作用。