【摘 要】
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SEQUEST与Mascot为目前蛋白组学分析研究中使用最为广泛的蛋白质库搜索工具。尝试将Mascot与SEQUEST搜索结果进行比较,进而采用不同多变量判别方法对二者的搜索结果进行判别
【机 构】
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中南大学化学化工学院中药现代化研究中心
【基金项目】
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本文系国家自然科学基金(No.20875104)和科技部国际国际合作项目(Nos.2006DFA41090,2007DA40680)资助
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SEQUEST与Mascot为目前蛋白组学分析研究中使用最为广泛的蛋白质库搜索工具。尝试将Mascot与SEQUEST搜索结果进行比较,进而采用不同多变量判别方法对二者的搜索结果进行判别分析,以降低其结果的假阳性率。通过对Mascot与SEQUEST搜索结果进行比较,发现所得结果差异很大;利用多变量判别分析方法对Mascot及SEQUEST搜索结果进行判别分析,可有效提高SEQUEST结果中假阳性结果与正确结果之间的区分能力。对于Mascot搜索结果,采用多变量判别分析方法仍无法显著降低其假阳性结果,利用
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