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不同地理来源的蔗茅无性系集中种植后的抽穗斯与原生长地海拔高度有明显相关:海拔〈1500m,抽穗斯随海拔升高而延迟;海拔〉1500m,抽穗斯随海拔升高而提早。其花药减粉分裂时的染色体配对构型略有差异,但2N=20未发现变异。蔗茅同一个体不同小穗内的花效数目的变异为0-3枚,其花量适中,花粉发育良好,是甘蔗杂交育种中很有利用价值的优良父本。