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根据中国区域1999--2008年的技术创新相关数据，利用空间过滤理论、面板协整理论及包含区域异质效应的随机前沿模型对中国区域创新效率及影响因素进行研究。结果发现：中国区域创新存在着明显的空间相关性，空间过滤可以有效地消除变量的空间相关性进而可以应用经典协整模型来进行分析；考虑区域异质效应的面板SFA模型，其参数估计结果更准确，从而技术效率的计算也更准确；中国区域技术创新效率显现东部高、中部中、西部低的空间分布特征；区域基础设施和区域市场开放度是影响区域技术创新效率的主要的显著因素。