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先天性食管闭锁远近端距离太远，或后天性烧伤狭窄长段不能修复，都可能遇到长段食管短缺的问题。两者不同之处在于：前者常需切断合并的气管瘘，后者常需切除或引流废用的残余食管。先天性食管气管瘘一般切断缝合即可，烧伤后的残余气管切除常很困难。一般多行上端（近口腔端）关闭，下端（近胃端）保证引流入胃。以后，处理食管缺损问题，两者采用技术基本一样。