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胚胎对于母体来说是半同种移植物，成功植入的胚胎之所以不被母体排斥，是由于母胎界面存在一系列免疫耐受机制。米非司酮是一种孕激素拮抗剂，可通过影响滋养细胞表面分子的表达和母体免疫细胞（自然杀伤细胞、巨噬细胞、T淋巴细胞）、免疫调节因子（Th1／Th2型细胞因子、孕激素诱导阻断因子、白血病抑制因子等）的功能，破坏母胎界面免疫耐受机制。