目的:探讨并对比分析足月妊娠宫腔及宫腔周围内环境菌群的特征。方法:选取2018年1月～2018年7月在北京大学深圳医院行足月剖宫产的26例孕妇。分别对孕妇宫颈管、盆腔、直肠、胎盘和羊水取样,提取总DNA,经16S rRNA V4区引物扩增、高通量测序及序列优化,通过生物信息分析比较不同部位菌群的特征。结果:(1)26例孕妇共收集114份样本,包括宫颈管、盆腔和胎盘样本各26份,羊水样本24例,直肠样本12例。所有样本经测序获得序列3019260条,经优化获得序列2544703条用于数据分析。(2)门分类水平上,宫颈管主要菌群为厚壁菌门(77.5%)和放线菌门(18.5%);盆腔主要菌群为变形菌门(65.7%)和厚壁菌门(16.4%);直肠主要菌群为厚壁菌门(52.1%)和拟杆菌门(39.1%);羊水主要菌群为变形菌门(67.5%)和厚壁菌门(12.3%);胎盘主要菌群为变形菌门(54.6%)和厚壁菌门(30.2%)。(3)属分类水平上,宫颈管主要菌群为乳杆菌属(75.9%)和加德纳菌属(14.8%);盆腔主要菌群为其他菌属(58.8%)和鞘氨醇单胞菌属(5.9%);直肠主要菌群为其他菌属(61.7%)和普氏菌属(28.9%);羊水主要菌群为其他菌属(54.0%)和窄食单胞菌属(7.6%);胎盘主要菌群为其他菌属(47.7%)和乳杆菌属(20.6%)。(4)宫颈管菌群的Shannon指数和OTU数均明显小于其他部位(P<0.05),羊水、胎盘及盆腔菌群的Shannon指数和OTU数两两对比无显著差异(P>0.05)。(5)主成分分析(PCA)能明显区分宫颈管菌群、直肠菌群,但未能显著区分羊水、盆腔和胎盘3个部位的菌群。结论:羊水和胎盘内有菌群定植,以变形菌门为主,其组成和多样性与盆腔菌群相近,与宫颈管和直肠菌群显著不同。