从一级结构预测蛋白质稳定性——Guruprasad,Reedy 和 Pandit 方法

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介绍了一种从一级结构预测蛋白质稳定性的方法.Guruprasad,Reedy 和 Pa-ndit 对32种稳定蛋白质和12种不稳定蛋白质进行了统计分析,发现存在这样一些二肽,它们在稳定的和不稳定蛋白质中的出现频率是明显不同的.通过一系列的统计学计算处理,计算出所有400种二肽各自对蛋白质稳定性(或不稳定性)的影响大小,给它们设计了一个二肽不稳定性权值(DIWV).对一个给定的蛋白质,与它的序列长度相一致的这些 DIWV 的加和能帮助区分不稳定蛋白质和稳定蛋白质.这种方法对如何提高蛋白质的稳定性具有一定的指导意义.我们根据 Guruprasad 等人的方法计算了几个已知序列的蛋白质的稳定性指数,并由此推出它们的稳定性.
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